特色小鎮概念提出后，全國上下形成了一股建設熱潮，其中也出現了一些問題。
2017年4月，國家發改委成立7個調研組，分赴全國各地展開調研。浙江大學公共管理學院調研的重點任務是浙江省創新培育特色小鎮的機制和經驗。
以浙大公共管理學院院長、浙江省特色小鎮研究會會長郁建興為首的調研組在兩批共計78個省級特色小鎮創建名單中選取了6個小鎮進行深度調研，形成了一份調查報告，這份扎實的報告，值得一看。
用稅收優惠吸引企業，不可取
調研組在調研中發現，為吸引企業入駐，有些特色小鎮仍在采用稅收優惠、租金補貼、用地政策等傳統的招商引資模式。這被認為是開發區模式。
比如，一些小鎮對入駐企業采取一企一議的優惠政策，訪談中小鎮工作人員不愿透露具體細節，但可以猜測優惠力度肯定不小。
而基金小鎮的競爭尤其應該引起重視，因為基金公司屬于輕資產企業，流動性比較強，而目前全省基金類小鎮眾多，如山南基金小鎮、南湖基金小鎮、梅山基金小鎮等，很多基金公司僅僅在小鎮注冊，并沒有真正辦公，如果小鎮在優惠期過后沒有足夠的內生吸引力，那么企業隨時可能“用腳投票”離開。
人才引進難，也是很多小鎮遭遇的難題。
磐安江南藥鎮在2015年考核中，國千人才和國家級大師的引進人數均為零，這也是造成高端要素集聚這一項失分的原因所在。2016年，這兩項都實現了零的突破，但過程艱難。
臺商小鎮建設指揮部副主任劉榮杰也坦言，不要說985、211的畢業生了，就是普通高校的畢業生，也很難回流。
調研團隊也發現，調研的特色小鎮普遍反映了人才短缺的問題，表示這會成為特色小鎮發展的瓶頸。
目前，各地也出臺了相應的人才政策，但存在著匹配度不高的問題。
有的地方官員重績效輕服務
按照浙江省的相關政策規定，特色小鎮要在三年內完成30-50億元的投資額。但是，不同的小鎮成長周期不同，特色小鎮還要實現“產、城、人、文”融合的目標，3-5年的時間恐怕遠遠不夠。從這個角度看，頂層設計應該更靈活，投資不拘泥于30-50億元的額度，關鍵看成效；創建時間不拘泥于3-5年，關鍵是內核是否有實質性進展等。
政府觀念上，目前政府應該在特色小鎮建設中承擔什么樣的責任，以及怎樣擔責，仍然不夠清晰，這就造成政府還是重績效輕服務。調研中，有的地方官員在談到吸引投資、稅收等經濟硬指標時往往興致勃勃，強調成績如何斐然，而在談到引進和留住人才、公共服務配套以及社區營造等則直言困難重重。
浙江的特色小鎮在推進的過程中，未來需要注意什么，調研報告中也給出了建議。
比如避免僅靠政策優惠來培育特色小鎮。調研表明，市場因素是影響企業選址最主要的因素，政策的影響相對有限。
此外要避免特色小鎮“一刀切”的頂層設計。特色小鎮正因為其特色才稱為特色小鎮，因此不能用固定的標準進行比較和評判。
